Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms