Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms