Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CENPFP49454 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CENPFP49454 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CENPFP49454 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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