Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms