Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ATP4AP20648 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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