Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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