Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-1B6SEH8 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms