Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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