Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CTNNA3Q9UI47 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CTNNA3Q9UI47 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms