Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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TIMMDC1Q9NPL8 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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TIMMDC1Q9NPL8 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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TIMMDC1Q9NPL8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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TIMMDC1Q9NPL8 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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