Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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