Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms