Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
R3HDM1Q15032 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms