Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms