| RUNX3 | Q13761 | LINC01359-206 | ENST00000634775 | 888 nt | TSL 5 BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FRMD7-202 | ENST00000370879 | 2864 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-221 | ENST00000636130 | 7748 nt | TSL 5 BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF383-201 | ENST00000352998 | 6760 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-245 | ENST00000637284 | 2423 nt | TSL 5 BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MSANTD2-204 | ENST00000526629 | 3086 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PROX1-205 | ENST00000498508 | 8498 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGEF6-203 | ENST00000370622 | 4779 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAT2-201 | ENST00000286479 | 1322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC1A3-215 | ENST00000612708 | 3832 nt | TSL 5 BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01249-201 | ENST00000412134 | 2663 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TSPAN8-202 | ENST00000393330 | 1516 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.18 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5A2-203 | ENST00000641673 | 9444 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000808.1-201 | ENST00000512200 | 3252 nt | TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMNDC1-202 | ENST00000369603 | 4341 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASC1-204 | ENST00000395990 | 2417 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTBK2-201 | ENST00000267890 | 10905 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFP14-201 | ENST00000270001 | 7489 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1-203 | ENST00000393820 | 1598 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERCC6L-201 | ENST00000334463 | 4243 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109811.1-201 | ENST00000512833 | 2807 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPGRIP1L-212 | ENST00000621565 | 6038 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP3K20-202 | ENST00000375213 | 3741 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GVINP1-202 | ENST00000531871 | 7271 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034229.2-201 | ENST00000566945 | 2508 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079741.1-201 | ENST00000321498 | 212 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6X1-201 | ENST00000327930 | 1058 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELSPBP1-201 | ENST00000339841 | 1052 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP186-201 | ENST00000365371 | 303 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA2.3-201 | ENST00000383920 | 135 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCL7-202 | ENST00000394627 | 696 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P7-201 | ENST00000400214 | 611 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP113-201 | ENST00000410486 | 84 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C6orf52-203 | ENST00000426700 | 493 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590666.1-201 | ENST00000428641 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF230666.1-201 | ENST00000429151 | 786 nt | TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC36A1-202 | ENST00000429484 | 977 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138761.5-201 | ENST00000433967 | 325 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133247.1-201 | ENST00000435713 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073264.2-201 | ENST00000448886 | 166 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBMY2TP-201 | ENST00000451162 | 947 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAAR4P-201 | ENST00000454843 | 1039 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096543.1-201 | ENST00000455038 | 823 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356390.1-201 | ENST00000455684 | 397 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFA12P1-201 | ENST00000455914 | 406 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068196.1-201 | ENST00000456895 | 833 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073218.1-201 | ENST00000458413 | 171 nt | TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL197P-201 | ENST00000466981 | 299 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEPT7P9-201 | ENST00000475691 | 413 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL481P-201 | ENST00000477764 | 299 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR383656.1-201 | ENST00000484916 | 377 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THAP6-212 | ENST00000508105 | 1103 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB9BP1-201 | ENST00000519581 | 626 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124067.3-201 | ENST00000522643 | 847 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC132219.1-201 | ENST00000524337 | 478 nt | TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006289.1-201 | ENST00000538089 | 277 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02156-201 | ENST00000552320 | 483 nt | TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139022.1-201 | ENST00000556127 | 486 nt | TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV30-201 | ENST00000557168 | 337 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114684.1-201 | ENST00000587659 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7515HG-226 | ENST00000588330 | 1055 nt | TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL27-207 | ENST00000590864 | 569 nt | TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTRNR2L12-201 | ENST00000600213 | 1049 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008745.1-201 | ENST00000604064 | 271 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL391358.1-201 | ENST00000605342 | 190 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR378J-201 | ENST00000611988 | 109 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000095.2-202 | ENST00000637415 | 154 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358975.1-203 | ENST00000413352 | 2932 nt | TSL 3 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TLR5-205 | ENST00000540964 | 4088 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NKRF-202 | ENST00000371527 | 3741 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF83-204 | ENST00000545872 | 2633 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002512.4-202 | ENST00000641599 | 4530 nt | BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLYATL1-201 | ENST00000300079 | 2068 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1-210 | ENST00000610520 | 3447 nt | TSL 5 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMARCE1-208 | ENST00000474246 | 2124 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP1B4-202 | ENST00000361319 | 3856 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TOX3-202 | ENST00000407228 | 3124 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.17 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007159.1-201 | ENST00000566529 | 4706 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNDC8-201 | ENST00000374507 | 1787 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP3K19-204 | ENST00000392915 | 5030 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099329.2-203 | ENST00000471537 | 3605 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HHLA2-209 | ENST00000489514 | 2406 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LARS-201 | ENST00000274562 | 2213 nt | TSL 2 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR52E5-201 | ENST00000610445 | 2244 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DYNC1I2-225 | ENST00000508530 | 2494 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DUSP19-202 | ENST00000354221 | 5176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UGT2B15-201 | ENST00000338206 | 2077 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139426.3-201 | ENST00000605648 | 2059 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS41-203 | ENST00000395969 | 3181 nt | TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB3GAP1-207 | ENST00000539493 | 3161 nt | TSL 5 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-32P-201 | ENST00000363937 | 159 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAV16-201 | ENST00000390444 | 329 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL10P10-201 | ENST00000403509 | 664 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB28P1-201 | ENST00000411517 | 641 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC119751.6-201 | ENST00000416712 | 186 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNMA1-AS3-201 | ENST00000418515 | 701 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006369.1-201 | ENST00000419425 | 548 nt | TSL 3 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01690-201 | ENST00000424837 | 576 nt | TSL 2 BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7AP49-201 | ENST00000429522 | 581 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009238.2-201 | ENST00000431026 | 355 nt | BASIC | 5.16 | □□□□□ -1.58 | | |