Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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