Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTCH1Q13635 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTCH1Q13635 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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