Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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CDH18Q13634 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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