Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL1Q13616 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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