Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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