Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms