Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ABHD3-205ENST00000578270 2080 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL929601.3-201ENST00000613990 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF726-201ENST00000322487 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ZNF790-208ENST00000615484 2451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC025031.5-201ENST00000623851 2523 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TP63-210ENST00000440651 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 CREM-204ENST00000345491 2220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 ACSL5-205ENST00000433418 3281 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXC1Q12948 DNALI1-201ENST00000296218 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms