Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LMAN2Q12907 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LMAN2Q12907 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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