Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SCAPQ12770 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCAPQ12770 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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