Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms