Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TSPOP30536 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms