Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD8P13378 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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