Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CEP290O15078 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CEP290O15078 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CEP290O15078 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CEP290O15078 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CEP290O15078 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CEP290O15078 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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