Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
C16orf54Q6UWD8 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms