Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms