Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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LAMA3Q16787 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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LAMA3Q16787 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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