Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms