Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SYCP1Q15431 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SYCP1Q15431 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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