Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NFIXQ14938 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NFIXQ14938 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms