Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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CUL4AQ13619 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4AQ13619 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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