Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms