Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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IFT88Q13099 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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IFT88Q13099 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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IFT88Q13099 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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