Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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