Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms