Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms