Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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