Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SCN11AQ9UI33 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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SCN11AQ9UI33 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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SCN11AQ9UI33 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SCN11AQ9UI33 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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