Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHST11Q9NPF2 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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