Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PHACTR1Q9C0D0 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms