Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRAPPC9Q96Q05 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms