Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GCSAMQ8N6F7 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms