Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NRF1Q16656 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.1 ms