Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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