Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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CHD4Q14839 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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