Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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